病原微生物学的理论前沿已经从“一个病原导致一种疾病”的传统模式迈向“特定的菌群结构与功能影响和决定个体发育和疾病发生发展” 的“后巴斯德时代”。肠道菌群和肠道微生态如何调节免疫功能和相关疾病，是目前生物学与医学交叉研究的最前沿。当前面临的重大挑战是理解共生的生物学基础，及共生菌对发育，生理，健康和疾病的影响。

中科院上海巴斯德所微生物、发育与健康研究中心有先进的多组学，培养组学，微流控和成像技术平台以支持研究需求，拟挖掘肠道微生态与免疫调节的决定性因子，从而开辟多种重大疾病的干预策略。

有关本中心的更多信息，请访问：www.ips.ac.cn/CMDH

CMDH现正积极招聘副研究员，分属5个不同的研究组:

1) Jean-Marc COLLARD研究员领导的实验细菌研究组

该课题组的目标是解读人类新生儿期和出生后1000天内肠道微生物群的建立和变化，以更好地了解肠道微生物群逐步建立的制约因素、环境因素的影响和动态变化。解决微生物菌群的失调和疾病状态。为了实现这些目标，拟采用宏分类学、单细胞分析和培养学相结合的方法，深入探究细菌群落的构建和由此产生的原核生物-原核生物共生。该课题组将与其他课题组紧密合作，特别是开发微流控、器官芯片技术、无菌动物和组学相关的课题组。

申请人应与中国科学院上海巴斯德研究所微生物、发育与健康研究中心（CMDH）的其他课题组密切交流（基因组学和蛋白质组学）。同时，根据申请人的资历情况（毕业年限，职称等），给予不同的岗位/待遇。

任职条件：

-在细菌学/营养学方面发表过文章，证实了其经验 (厌氧菌学更佳) 。

-任职者应精通：

从不同生物基质中分离和培养细菌。

鉴定细菌(生化特性、16S rDNA测序、MALDI-TOF质谱)

分子生物学（即qPCR、克隆）。

着手对新发现的细菌进行（比较）基因组分析。

具有良好的职业道德、人格和品德。

具有良好的中英文沟通能力。

联系方式: 研究员、课题组长:jean-marc.collard@ips.ac.cn/ 实验室助理:lzhao@ips.ac.cn

2) Daniel FALUSH研究员领导的病原菌定量基因组学研究组

病原菌定量基因组欲招聘一名副研究员，其主要职责是与晁彦杰领导的RNA系统生物学组进行合作，共同研究自然细菌种群中发现的基因变异功能。

该组对包括副溶血弧菌和幽门螺杆菌在内的细菌种群进行了大规模的基因组变异调查，并发现了对特定菌株适应其利基有重大贡献的基因组。受聘的副研究员将管理一个小型研究小组，负责在湿实验室中描述细菌表型和转录组图谱。

任职条件：

需要一位在细菌学方面经验丰富的高级研究人员，并对基因组学、进化和微生物学之间的交叉领域感兴趣。

联系方式：研究员、课题组长：daniel.falush@ips.ac.cn/ 实验室助理：bgu@ips.ac.cn

3) Parag KUNDU研究员领导的肠道菌群与宿主相互作用研究组

该研究组致力于了解肠道菌群和宿主干细胞之间的相互作用，主要目标之一是阐明肠道菌群的功能，研究机体在生长发育不同阶段，稳态和失调状态下，肠道菌群与肠道/神经干细胞错综复杂的相互作用。

现该研究组诚聘肠道菌群和宿主健康领域全职副研究员。希望应聘者能够使用系统生物学方法来解读微生物、干细胞和宿主健康之间的关系，了解多种技术，如转基因、无菌小鼠的菌群移植，掌握神经球和小肠类器官等体外平台的构建。我们鼓励以假设为驱动的跨学科交流，包括动物模型、组学和细胞信号传导等研究。

任职条件：

-申请人应具有细胞生物学或微生物学/肠道菌群研究方向的博士学位，并具有广泛的技术专长。

-具备干细胞生物学、神经生物学、宿主微生物相互作用和高通量测序技术等方面的知识。

-有肠道类器官或神经球培养经验者优先。

-申请人应具有高度的积极性，熟悉中国的基金申请系统，能够独立申请基金。

联系方式： 研究员、课题组长：parag.kundu@ips.ac.cn/ 实验室助理：slxing@ips.ac.cn

4) Richard LO-MAN研究员领导的免疫和小儿传染病研究组

该研究组诚招一位有经验的生物信息学家/计算生物学家加入我们的课题组，担任副研究员。该组工作重点是结合免疫学及系统生物学方法来揭示小儿疾病中微生物群和免疫系统的关系。申请人需负责实验室数据分析，主要职责包括管理并分析大型数据集以及开发新颖的分析方法；独立开展课题。

主要职责：

-开发并运行计算策略，用于诠释通过单细胞及长读测序技术获得的DNA/RNA数据，包括开发统计分析，设计和实施有效的分析渠道；

-管理、培训工作人员和学生使用计算生物学工具。

任职条件：

-计算生物学、统计生物学、生物物理学、生物信息学或相关领域的博士。

-熟练使用R和/或Python进行编程；

-具有数据挖掘经验，如参数和非参数统计方法、维度降低方法、多变量分析、贝叶斯统计或分类方法。

联系方式： 研究员、课题组长：richard.loman@ips.ac.cn

5)Nicolas Berthet研究员领导的病原发现及其分子特征研究组

病原发现及其分子特征研究组是一个年轻并且充满活力的研究组，主要研究方向为病原微生物方面以及在分子水平上对这些病原微生物进行鉴定，特别是病毒。研究组利用多种二代及三代高通量测序技术研究与发现新病原微生物，尤其是宿主为动物的病原体，深入鉴定整合入其宿主基因组的病毒基因组以及肠道宏病毒组，特别是噬菌体组。

因科研事业发展需要，病原发现及其分子特征研究组现向国内外公开招聘应用微生物学领域副研究员一名。该岗位职责为展开不同研究项目，研究噬菌体如何影响肠道菌群的细菌群落。研究组鼓励以假设驱动的跨学科研究。

任职条件：

拥有病毒学/微生物学/微生物菌群研究背景的博士学位，技术专业领域广泛；

拥有分子生物学、噬菌体分离或相关实验、高通量测序技术及/或数据分析方面经验更佳；

必须具有高度积极性、良好的团队合作精神及职业道德，并且能够独立申请基金；

良好的英语沟通能力。

联系方式： 研究员、课题组长：nicolas.berthet@ips.ac.cn/ 实验室助理：ywtian@ips.ac.cn

申请流程:

申请书必须包含以下英文文件:

完整的简历, 包括博士论文, 工作经历, 过往学术职务, 学术荣誉, 现任职务, 以及获得过的资助和完整的文献出版物清单。

目前工作内容和未来研究计划的摘要（不超过两页纸）。

申请书应通过电子邮件发送至相应的PI和实验室助理，以及emilie.carlot@ips.ac.cn和jdshen@ips.ac.cn。

拟招聘职位长期有效，直至招满为止。